Управление МБУДО ДШИ № 25 осуществляется на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности.
Единоличным исполнительным органом является Директор, осуществляющий текущее руководство деятельностью учреждения.
Коллегиальными органами управления являются:
Структура, порядок формирования, срок полномочий и компетенция органов управления, порядок принятия ими решений и выступления от имени ДШИ № 25 устанавливаются Уставом учреждения, локальными нормативными актами.
В школе функционируют 5 структурных подразделений:
вокально-сценическое и мультимедиа отделение;
школа раннего эстетического развития.
Деятельность структурных подразделений регулируется локальным нормативным актом.
С 2006 года действует НОФ «Попечительский совет Детской школы искусств № 25»